南阳市中心医院消化二科是河南省重点培育专科，南阳市重点专科。在科主任张向东的带领下，消化二科亚专业齐全、人才济济，临床、教学及科研力量雄厚，目前设有专家门诊、病房、内镜诊疗室、胶囊内镜检查室、临床药物试验室和消化病研究室；共有医务人员31人，其中主任医师3人、副主任医师3人、主治医师5人、住院医师1人、主管护师4人、护师14人、护士1人；并先后公派10余名医务人员外出学习，积极参加各种学术交流活动；近年来，全科发表国家级以上论文100余篇，主持省级科研课题 5项，获多项厅、市级科研成果。

科室开放床位80余张，每年收住近5000余例来自南阳及周边地区的患者。诊疗范围包括食管、胃、肠、肝胆、胰腺等消化系统疾病，并在消化道大出血、急性重症胰腺炎、肝衰竭、肝性脑病等疑难复杂病例的救治方面有丰富的临床经验。长期开展无创性诊断幽门螺旋杆菌感染的13C呼气试验，人工肝治疗肝衰竭，持续血液滤过治疗重症胰腺炎，干细胞移植治疗晚期肝病等，并与放射科、放疗科合作开展消化道肿瘤性疾病的放化疗及介入治疗。

消化内镜室位于门诊4楼，年诊疗量达6000余例，配备有国内先进的日本Olympus电子胃镜、电子十二指肠镜、胶囊内镜、高频电切刀、球囊扩张器等。长期开展内镜下各种胃肠道疾病的诊断及治疗工作，如EMR/ESD(消化道大息肉、平滑肌瘤、间质瘤、早癌切除)、食管胃底静脉曲张套扎术、组织胶及硬化剂注射术、金属钛夹止血术、食管狭窄扩张术、食管支架植入术等，先进的微创治疗使广大患者免受开胸开腹等大手术的风险与痛苦。