肝胆胰外科成立于2002年，院内重点专科，现拥有3个病区，开设床位150张；专家11人，其中主任医师3人，副主任医师8人，主治医师12人；硕士生导师3人，博士6人，硕士14人。年度门诊量约为17000人次，出院患者3500人次，手术约1600台次。
科室开展各种高难度手术：胰十二指肠扩大切除术，胰体尾癌切除术，胆管（囊）癌扩大根治术，合并半肝或门脉切除重建的肝门部胆管癌根治术，各种肝叶肝段切除术以及高难度的超半肝切除、肝尾状叶切除术、门静脉切开癌栓清除术及腹腔镜下肝切除术等，术后并发症发生率、生存率等指标均已跨入国内先进行列。开展的肝癌及胰腺癌腹腔镜手术填补了省内空白。先后开展的射频消融肿瘤毁损治疗、核素粒子植入治疗、肝动脉肝癌栓塞化疗、HIFU等，为不能进行手术根治的患者提供更个体化的治疗措施。